La investigación de la Universidad Tecnológica de Sídney (UTS), que analiza grandes cantidades de datos sobre el cáncer infantil para adaptar mejor el tratamiento, está un paso más cerca de ayudar a los médicos, ya que la colaboración con el Instituto de Investigación Infantil del Hospital Infantil de Westmead cumple 12 años.
Paul Kennedy, del Centro de Computación Cuántica y Sistemas Inteligentes de la UTS, ha estado trabajando en estrecha colaboración con Dan Catchpoole, del Instituto de Investigación Infantil, para crear un conducto virtual que visualice grandes cantidades de datos de pacientes con el fin de ayudar a los médicos de los hospitales a diagnosticar y tratar mejor a los pacientes con cáncer infantil.
“Hemos llegado a un punto emocionante en nuestra investigación, ya que por fin estamos reuniendo todas las piezas en las que hemos estado trabajando durante años”, afirmó Kennedy. “No siempre se tiene la oportunidad de trabajar en cosas como esta. Puede tener un efecto muy grande y cambiar realmente la vida de los niños. Por eso es un gran honor realizar esta investigación’.”
El cáncer es la enfermedad más mortal entre los niños de Australia, con 700 casos diagnosticados cada año. El tratamiento actual se basa en agrupar a los pacientes en categorías de riesgo, siendo la categoría de alto riesgo de recaída la que requiere el tratamiento más intenso disponible.
Sin embargo, este proyecto de investigación colaborativo busca alejarse de las categorías para personalizar el tratamiento. Mediante la interpretación visual de los datos biológicos de pacientes con cáncer infantil, el canal virtual del equipo de investigación puede comparar los datos de expresión génica y las variaciones genéticas de pacientes actuales y anteriores, así como los datos clínicos y de imágenes. De este modo, puede ayudar mejor a los médicos a determinar el régimen de tratamiento que ofrecerá la respuesta clínica más segura para los pacientes.
“Consideramos que las muestras de tejido tumoral son ‘pequeños paquetes de información’ sobre el paciente y su enfermedad. Esta información se puede desentrañar muy rápidamente mediante las tecnologías actuales de secuenciación del ADN u ‘ómicas’, lo que nos deja con una gran cantidad de datos que hay que clasificar, filtrar y interpretar”, afirma Catchpoole.
“Los enfoques computacionales utilizados por Paul Kennedy nos permitirán ‘extraer’ rápidamente esta información para obtener los conocimientos que podamos utilizar para evaluar la mejor forma de tratar a un paciente en la clínica”.”
El equipo está trabajando actualmente para garantizar que sus modelos sean robustos y capaces de clasificar grandes cantidades de datos. También están analizando cómo la canalización virtual puede contribuir mejor a las prácticas clínicas existentes. ’Los médicos son los expertos y nosotros solo queremos ayudarles a hacer su trabajo. No queremos presentarles un enfoque centrado en la computadora, sino un enfoque humano del análisis de datos“.”
Otros académicos de la UTS también han contribuido con sus conocimientos al proyecto. Karla Félix Navarro, del Centro de Innovación en Aplicaciones de Servicios de TI de la UTS, ha colaborado en el desarrollo del software para el conducto.
“Trabajar con Paul y Dan ha sido una experiencia fantástica”, afirmó Navarro. “He aprendido mucho sobre el neuroblastoma (un tipo de cáncer que afecta casi exclusivamente a bebés y niños), la expresión génica y la medicina personalizada gracias a las reuniones que hemos organizado con investigadores y médicos. Me entusiasma el gran impacto que los sistemas de diagnóstico asistido por computadora, la minería de datos, la visualización de datos, la interacción persona-computadora y otros métodos informáticos pueden tener en la supervivencia de los pacientes”.”
Otros colaboradores son la Universidad de Western Sydney, la Universidad Queen's de Canadá y los Institutos Nacionales de Salud de EE. UU. Los estudiantes de la UTS también han participado activamente en el proyecto, incluyendo cuatro doctorados completados, un doctorado en curso y un estudiante con honores.
La investigación se centra en la leucemia linfoblástica aguda, el cáncer infantil más común. Sin embargo, Kennedy también está trabajando con Catchpoole en un sistema de diagnóstico asistido por computadora para el rabdomiosarcoma y el neuroblastoma.
Fuente: UTS
Fecha: 26 de noviembre de 2014
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Presentado por Fomat Médico